En decemberdag 1925 tar Vera Grund från Berlin tåget norrut. Med sig har hon en resväska med lite kläder, en karta och ett par adresser. Hon är på upptäcktsfärd i sitt eget förflutna. Under tre dagar kommer hon att vistas i ett Stockholm på väg att snöa igen. I en gammal malmgård omgiven av rykten bläddrar samtidigt professor Schaumberg igenom sina akter. Han är anatom och själsbiolog i vanrykte. En gång var han uppburen medlem av landets vetenskapliga akademier och mannen bakom den mytomspunna Hjärnklubben. Veras och professorns öden är mera sammantvinnade än någon av dem ännu anar. Då tåget ankommer till Stockholm kan sista akten i dramat inledas.
Stockholm noir bygger delvis på verkliga händelser. Det är en biologisk thriller, en mörk saga om hjärnans natur och själens möjliga hemvist. Men också ett lyriskt porträtt av en stad som präglar sina invånare på gåtfulla sätt.